Über mich

Über mich



Dr. Thomas Stempfl
geb. am 09.09.1972
verheiratet, 2 Kinder



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Lebenslauf

 

seit 2019:
Leiter der Sequenzierungs-Facility Genomics Core Unit der Universität Regensburg

2011 – 2019:
Leiter des Zentralprojekts Deep Sequencing im Sonderforschungsbereich 960 Ribosome formation: principles of RNP biogenesis and control of their function, Universität Regensburg.

2009 – 2013:
Mitglied und Projektpartner beim EU-FP7-Projekt TRANSVAC – European Network of Vaccine Development and Research

2007 – 2018:
Geschäftsführender Leiter des Kompetenzzentrum Fluoreszente Bioanalytik, Biopark Regensburg.

2003 – 2006:
Projektleiter, Klinik und Poliklinik für Neurologie am Bezirksklinikum Regensburg.

1999:
Forschungsaufenthalt bei Prof. Jeffrey Hall (Nobelpreis für Medizin 2017), Faculty of Biology, Brandeis University, Waltham MA, USA.

1998 – 2002:
Promotion (Dr. rer. nat.) am Lehrstuhl für Entwicklungsbiologie der Universität Regensburg. Dissertation Ein genetischer Screen zur Isolierung und Charakterisierung circadian regulierter Gene aus Drosophila melanogaster; Abschluss mit Magna Cum Laude.

1998:
Diplomarbeit: Klonierung und molekulare Charakterisierung des swiss cheese- (sws-) Homologs aus der Maus. Note 1,0.

1995-1996:
Stipendiat des DAAD; Studium an der Washington University, St. Louis MO, USA. Forschungsaufenthalt bei Prof. Steven Weintraub, Washington University Medical School in St. Louis.

1992-1998:
Studium der Biologie (Diplom) an der Universität Regensburg.

1991-1992:
Zivildienst an der Waldburg-Zeil Fachklinik für Orthopädie, Physikalische und Rehabilitative Medizin (Klinik Niederbayern), Bad Füssing.

1991:
Allgemeine Hochschulreife (Abitur) am Wilhelm-Diess-Gymnasium Pocking; Durchschnittsnote 1,3

Zusatzqualifikationen

 

Projektleiter gentechnischer Arbeiten (staatlich anerkannter Sachkundenachweis 2022) nach §§28 der Gentechnik-Sicherheitsverordnung (GenTSV).

Beauftragter für Biologische Sicherheit (staatlich anerkannter Sachkundenachweis 2022) nach §§30 der Gentechnik-Sicherheitsverordnung (GenTSV).

Fortbildung EU-Beihilfenrecht im Hochschul- und Forschungsbereich, PROvendis IP-Akademie (2017), Mühlheim/Ruhr.

Ausbildung zum betrieblichen Ersthelfer.

Wissenschaftliche Publikationen

[Hinweis: nur Publikationen mit Co-Autorenschaft sind aufgeführt. Eine vollständige Liste mit > 300 peer-reviewed Publikationen ohne Co-Autorenschaft, aber mit direkter Beteiligung und/oder Nennung im Acknowledgement, ist hier zu finden.]

 

2023:

Obermeyer S, Stöckl R, Schnekenburger T, Kapoor H, Stempfl T, Schwartz U, Grasser KD. TFIIS Is Crucial During Early Transcript Elongation for Transcriptional Reprogramming in Response to Heat Stress. J Mol Biol. 2023 Jan 30;435(2):167917. doi: 10.1016/j.jmb.2022.167917. Epub 2022 Dec 9. PMID: 36502880.

2021:

Schelker RC, Kratzer A, Müller G, Brochhausen C, Hart C, Stempfl T, Heudobler D, Moehle C, Herr W, Iberl S, Grassinger J. Stanniocalcin 1 is overexpressed in multipotent mesenchymal stromal cells from acute myeloid leukemia patients. Hematology. 2021 Dec;26(1):565-576. doi: 10.1080/16078454.2021.1962048. PMID: 34384344.

2020:

Müller S, Wallner S, Schmitz G, Loew T, Stempfl T, Möhle C, Strack C, Sag S, Baessler A, Fischer M. SNP dependent modulation of circulating miRNAs from the miR25/93/106 cluster in patients undergoing weight loss. Gene. 2020 Aug 30;753:144787. doi: 10.1016/j.gene.2020.144787. Epub 2020 May 18. PMID: 32439373.

2019:

Berger RS, Ellmann L, Reinders J, Kreutz M, Stempfl T, Oefner PJ, Dettmer K. Degradation of D-2-hydroxyglutarate in the presence of isocitrate dehydrogenase mutations. Sci Rep. 2019 May 15;9(1):7436. doi: 10.1038/s41598-019-43891-3. PMID: 31092874; PMCID: PMC6520482.

2018:

Chittka D, Banas B, Lennartz L, Putz FJ, Eidenschink K, Beck S, Stempfl T, Moehle C, Reichelt-Wurm S, Banas MC. Long-term expression of glomerular genes in diabetic nephropathy. Nephrol Dial Transplant. 2018 Sep 1;33(9):1533-1544. doi: 10.1093/ndt/gfx359. PMID: 29340699.

2017:

Szczyrba J, Jung V, Beitzinger M, Nolte E, Wach S, Hart M, Sapich S, Wiesehöfer M, Taubert H, Wennemuth G, Eichner N, Stempfl T, Wullich B, Meister G, Grässer FA. Analysis of Argonaute Complex Bound mRNAs in DU145 Prostate Carcinoma Cells Reveals New miRNA Target Genes. Prostate Cancer. 2017;2017:4893921. doi: 10.1155/2017/4893921. Epub 2017 Jan 5. PMID: 28163933; PMCID: PMC5253174.

Safronov O, Kreuzwieser J, Haberer G, Alyousif MS, Schulze W, Al-Harbi N, Arab L, Ache P, Stempfl T, Kruse J, Mayer KX, Hedrich R, Rennenberg H, Salojärvi J, Kangasjärvi J. Detecting early signs of heat and drought stress in Phoenix dactylifera (date palm). PLoS One. 2017 Jun 1;12(6):e0177883. doi: 10.1371/journal.pone.0177883. PMID: 28570677; PMCID: PMC5453443.

Tay TL, Mai D, Dautzenberg J, Fernández-Klett F, Lin G, Sagar, Datta M, Drougard A, Stempfl T, Ardura-Fabregat A, Staszewski O, Margineanu A, Sporbert A, Steinmetz LM, Pospisilik JA, Jung S, Priller J, Grün D, Ronneberger O, Prinz M. A new fate mapping system reveals context-dependent random or clonal expansion of microglia. Nat Neurosci. 2017 Jun;20(6):793-803. doi: 10.1038/nn.4547. Epub 2017 Apr 17. PMID: 28414331.

2015:

Brunner SM, Rubner C, Kesselring R, Martin M, Griesshammer E, Ruemmele P, Stempfl T, Teufel A, Schlitt HJ, Fichtner-Feigl S. Tumor-infiltrating, interleukin-33-producing effector-memory CD8(+) T cells in resected hepatocellular carcinoma prolong patient survival. Hepatology. 2015 Jun;61(6):1957-67. doi: 10.1002/hep.27728. Epub 2015 Mar 18. PMID: 25645298.

Scholz R, Sobotka M, Caramoy A, Stempfl T, Moehle C, Langmann T. Minocycline counter-regulates pro-inflammatory microglia responses in the retina and protects from degeneration. J Neuroinflammation. 2015 Nov 17;12:209. doi: 10.1186/s12974-015-0431-4. PMID: 26576678; PMCID: PMC4650866.

2014:

Dey S, Wenig M, Langen G, Sharma S, Kugler KG, Knappe C, Hause B, Bichlmeier M, Babaeizad V, Imani J, Janzik I, Stempfl T, Hückelhoven R, Kogel KH, Mayer KF, Vlot AC. Bacteria-triggered systemic immunity in barley is associated with WRKY and ETHYLENE RESPONSIVE FACTORs but not with salicylic acid. Plant Physiol. 2014 Dec;166(4):2133-51. doi: 10.1104/pp.114.249276. Epub 2014 Oct 20. PMID: 25332505; PMCID: PMC4256861.

2011:

Mauerer A, Roesch A, Hafner C, Stempfl T, Wild P, Meyer S, Landthaler M, Vogt T. Identification of new genes associated with melanoma. Exp Dermatol. 2011 Jun;20(6):502-7. doi: 10.1111/j.1600-0625.2011.01254.x. Epub 2011 Mar 16. PMID: 21410771.

2010:

Hafner C, Di Martino E, Pitt E, Stempfl T, Tomlinson D, Hartmann A, Landthaler M, Knowles M, Vogt T. FGFR3 mutation affects cell growth, apoptosis and attachment in keratinocytes. Exp Cell Res. 2010 Jul 15;316(12):2008-16. doi: 10.1016/j.yexcr.2010.04.021. Epub 2010 Apr 24. PMID: 20420824.

2009:

Hartmann A, Thieme M, Nanduri LK, Stempfl T, Moehle C, Kivisild T, Oefner PJ. Validation of microarray-based resequencing of 93 worldwide mitochondrial genomes. Hum Mutat. 2009 Jan;30(1):115-22. doi: 10.1002/humu.20816. PMID: 18623076.

2008:

Ebert S, Schoeberl T, Walczak Y, Stoecker K, Stempfl T, Moehle C, Weber BH, Langmann T. Chondroitin sulfate disaccharide stimulates microglia to adopt a novel regulatory phenotype. J Leukoc Biol. 2008 Sep;84(3):736-40. doi: 10.1189/jlb.0208138. Epub 2008 Jun 12. PMID: 18550791.

Hafner C, Stempfl T, Bäumler W, Hohenleutner U, Landthaler M, Vogt T. Gene expression profiling of melanocytes following Q-Switched Ruby laser irradiation. Dermatology. 2008;216(1):6-13. doi: 10.1159/000109352. PMID: 18032893.

Mueller AM, Pedré X, Stempfl T, Kleiter I, Couillard-Despres S, Aigner L, Giegerich G, Steinbrecher A. Novel role for SLPI in MOG-induced EAE revealed by spinal cord expression analysis. J Neuroinflammation. 2008 May 26;5:20. doi: 10.1186/1742-2094-5-20. PMID: 18501024; PMCID: PMC2438345.

Roesch A, Mueller AM, Stempfl T, Moehle C, Landthaler M, Vogt T. RBP2-H1/JARID1B is a transcriptional regulator with a tumor suppressive potential in melanoma cells. Int J Cancer. 2008 Mar 1;122(5):1047-57. doi: 10.1002/ijc.23211. PMID: 17973255.

Schweikl H, Hiller KA, Eckhardt A, Bolay C, Spagnuolo G, Stempfl T, Schmalz G. Differential gene expression involved in oxidative stress response caused by triethylene glycol dimethacrylate. Biomaterials. 2008 Apr;29(10):1377-87. doi: 10.1016/j.biomaterials.2007.11.049. Epub 2007 Dec 27. PMID: 18164055.

Weigelt K, Moehle C, Stempfl T, Weber B, Langmann T. An integrated workflow for analysis of ChIP-chip data. Biotechniques. 2008 Aug;45(2):131-2, 134, 136 passim. doi: 10.2144/000112819. PMID: 18687062.

2006:

Vollmann A, Vornlocher HP, Stempfl T, Brockhoff G, Apfel R, Bogdahn U. Effective silencing of EGFR with RNAi demonstrates non-EGFR dependent proliferation of glioma cells. Int J Oncol. 2006 Jun;28(6):1531-42. PMID: 16685454.

2002:

Stempfl T, Vogel M, Szabo G, Wülbeck C, Liu J, Hall JC, Stanewsky R. Identification of circadian-clock-regulated enhancers and genes of Drosophila melanogaster by transposon mobilization and luciferase reporting of cyclical gene expression. Genetics. 2002 Feb;160(2):571-93. doi: 10.1093/genetics/160.2.571. PMID: 11861563; PMCID: PMC1461973.

2000:

Moser M, Stempfl T, Li Y, Glynn P, Büttner R, Kretzschmar D. Cloning and expression of the murine sws/NTE gene. Mech Dev. 2000 Feb;90(2):279-82. doi: 10.1016/s0925-4773(99)00239-7. PMID: 10640712.

Vorträge/Workshops

 

Konferenz/Präsentation „German Conference on Bioinformatics (GCB)“ (2024), Universität Bielefeld.

Referent beim 120. Kongress der Deutschen Ophthalmologischen Gesellschaft: „RNAseq of the Cornea – gain or pitfall?“ (2022), Hotel Estrel, Berlin.

Präsentation auf der „SFB960 Conference – RNP Dynamics“ (2022), Marina Forum Regensburg.

Referent und Teilnehmer am jährlichen Workshop „Administrative Herausforderungen in Core Facilities und Technologieplattformen“ (2017/2018/2022/2023), MoMAN, Universität Ulm.

DFG-Workshop „Hochdurchsatz-Sequenzierung (NGS) in Deutschland“ (2016), DFG-Geschäftsstelle Bonn.

Präsentation „Technical Evaluation of RetChip 1.0 – a Custom Re-Sequencing Chip for an Array-Based Mutational Analysis of Retinal Degeneration“ (2008), Maastricht, NL.

Referent „Implementing ChIP-Chip Technology in an Affymetrix Core Lab – a field report“ (2007), Affymetrix Core Lab Directors Meeting, Windsor, UK.

Mitgliedschaften